Un gran debate se ha creado entre aquellas personas que defienden la iniciativa que pretende reglamentar el fuero penal milita y las que están en su contra. Sin duda alguna, los debates que se van a llevar a cabo para discutir el proyecto serán bastante agitados y mostraran un trámite muy espinoso, sobretodo porque acá se tocan temas como el respeto al derecho internacional humanitario, la seguridad jurídica de las Fuerzas Militares, la viabilidad de tramitar una ley para fortalecer la guerra de forma paralela a un proceso de paz o la necesidad de garantizar condiciones para que “los militares defiendan al país de la amenaza terrorista”, según se ha argumentado por parte de sus promotores.
 
El general Jaime Ruiz, presidente de la Asociación de Oficiales Retirados de las Fuerzas Militares (Acore), por medio de un comunicado leído hace poco, fue el punto que hizo crear la gran disputa, debido a que en su texto expreso que “los principales opositores al proyecto lo constituyen, como es habitual, la Corte Interamericana de Derechos Humanos y la Comisión Interamericana de Derechos Humanos, Human Rights Watch, algunos relatores de las Naciones Unidas, la Federación Internacional de Derechos Humanos, la Asociación Colombiana de Juristas Demócratas, los miembros del Partido Comunista del Polo Democrático, encabezados por el hijo de un importante y extinto líder de las Farc, Manuel Cepeda Vargas, y algunos colectivos de abogados que les son afines”.
 
La forma en la que continua la polémica sobre el Fuero Militar se agito mucho más cuando el  representante a la Cámara Iván Cepeda le dijo al general Ruiz que: “No sea cobarde. Con esas afirmaciones fue que gente de su institución asesinó a mi padre. Acá hubo una sesión, no sé si usted se enteró, en la que el Estado pidió perdón por el asesinato de mi padre. Le pido que si hizo la afirmación se sostenga porque le voy a entablar una denuncia penal. No es una amenaza, es una realidad. Usted no puede tratar a una persona que ha sido víctima de la violencia de esa manera, no la puede calumniar”.
 
Aunque para muchos la aprobación de la nueva reglamentación para el fuero militar se da como un hecho, y esto debido a que el mismo presidente Juan Manuel Santos se lo solicito al congreso, este es un tema que dará mucho que hablar y en el que la polémica seguirá estando vigente por muchos meses.